111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2868 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2868  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.653619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0819  hypothetical protein  61.48 
 
 
288 aa  364  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0139271  unclonable  0.00000805455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0357  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.17 
 
 
500 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  52.46 
 
 
527 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  52.46 
 
 
521 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4703  ThiJ/PfpI domain protein  50.35 
 
 
288 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1852  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.97 
 
 
312 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0384  ThiJ/PfpI domain protein  49.03 
 
 
308 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00197683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0828  hypothetical protein  28.17 
 
 
254 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.775057  unclonable  0.0000112363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  28.73 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  27.07 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0958  ThiJ/PfpI domain protein  25.56 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.61 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  29.79 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  24.8 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.7 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.8 
 
 
225 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.91 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.44 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  23.43 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  25.69 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  24.91 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  28.25 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.7 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  23.3 
 
 
261 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  24.51 
 
 
229 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  27.41 
 
 
230 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  27.41 
 
 
230 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  25.4 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  27.27 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  27.01 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  25 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  26.14 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  25.57 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  22.66 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  26.28 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  21.74 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  26.7 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.36 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  28.41 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  24.09 
 
 
223 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.14 
 
 
228 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  23.14 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  23.3 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  22.66 
 
 
220 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.41 
 
 
224 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  22.44 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  23.08 
 
 
220 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  24.43 
 
 
228 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.43 
 
 
228 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  24.41 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  23.19 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.95 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.43 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  23.53 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.02 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  23.08 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  23.08 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  25.14 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.13 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.89 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  24.43 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.13 
 
 
230 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.38 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  23.62 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  21.34 
 
 
230 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  23.08 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.13 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.13 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  24.43 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  22.96 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  23.03 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  21.32 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.54 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  24.12 
 
 
224 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 
230 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  23.73 
 
 
250 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  23.73 
 
 
250 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.86 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  24.24 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  24.43 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  23.35 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  26.7 
 
 
233 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  26.14 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  25.57 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  23.62 
 
 
232 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3480  ThiJ/PfpI  24 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.782484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.14 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  26.4 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  23.13 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  21.23 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  24.43 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  27.27 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  24.87 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>