More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0011 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  75.42 
 
 
179 aa  284  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  71.35 
 
 
179 aa  269  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  77.65 
 
 
179 aa  264  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  70.62 
 
 
173 aa  247  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  68.93 
 
 
181 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  68.36 
 
 
181 aa  241  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  70.79 
 
 
184 aa  231  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.04 
 
 
176 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  67.98 
 
 
177 aa  223  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  61.27 
 
 
178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  62.57 
 
 
175 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  61.45 
 
 
175 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  61.93 
 
 
181 aa  207  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  64.61 
 
 
182 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  58.43 
 
 
174 aa  203  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  58.99 
 
 
178 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  60.8 
 
 
187 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  61.14 
 
 
206 aa  201  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  59.89 
 
 
193 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.64 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  62.86 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  60.67 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  60.34 
 
 
176 aa  195  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  58.43 
 
 
176 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  61.45 
 
 
178 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  56.57 
 
 
174 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  61.14 
 
 
189 aa  187  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.13 
 
 
172 aa  187  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
182 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  54.8 
 
 
172 aa  184  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  59.66 
 
 
175 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  59.66 
 
 
175 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  59.66 
 
 
175 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  54.24 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  62.86 
 
 
170 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  59.43 
 
 
173 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  57.95 
 
 
182 aa  177  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  54.24 
 
 
241 aa  174  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  58.52 
 
 
177 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  58.89 
 
 
176 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  50.57 
 
 
188 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
287 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  49.43 
 
 
188 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.06 
 
 
201 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  48.04 
 
 
176 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  54.8 
 
 
180 aa  157  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  62.5 
 
 
168 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  61.81 
 
 
168 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  61.81 
 
 
168 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  50.28 
 
 
657 aa  156  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
228 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.75 
 
 
378 aa  154  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.59 
 
 
266 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.02 
 
 
376 aa  151  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  60.14 
 
 
168 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.48 
 
 
310 aa  147  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.26 
 
 
310 aa  144  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  45.51 
 
 
629 aa  144  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  44.94 
 
 
571 aa  142  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50 
 
 
372 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  46.96 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.39 
 
 
357 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.1 
 
 
218 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  45.25 
 
 
665 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  46.93 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  48.66 
 
 
179 aa  131  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.19 
 
 
629 aa  131  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  47.8 
 
 
310 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  45.9 
 
 
573 aa  127  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.21 
 
 
160 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  45.3 
 
 
163 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  48.95 
 
 
223 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  44.74 
 
 
181 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.22 
 
 
196 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  46.07 
 
 
164 aa  121  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.65 
 
 
164 aa  120  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  46.07 
 
 
164 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.9 
 
 
322 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.65 
 
 
468 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.32 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  48.52 
 
 
169 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  43.09 
 
 
533 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  39.61 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  44.13 
 
 
172 aa  117  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.42 
 
 
195 aa  117  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  47.55 
 
 
161 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.15 
 
 
230 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.15 
 
 
230 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  44.44 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.02 
 
 
219 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  45.1 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  46.15 
 
 
376 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  47.55 
 
 
254 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.16 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  45.45 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06894  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 2 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8)(Cyclophilin-60)(Cyclophilin-like protein Cyp-60) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXT6]  43.41 
 
 
580 aa  111  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.242482 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02320  conserved hypothetical protein  40.96 
 
 
491 aa  111  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0954  peptidylprolyl isomerase  36.06 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>