More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3301 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  216  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  71.7 
 
 		 106 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  68.87 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  68.87 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  70.75 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  63.81 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  63.81 
 
 		 106 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  62.86 
 
 		 107 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  63.11 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  59.43 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  143  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  143  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  53.85 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  60 
 
 		 106 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.22 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  55.24 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  57.43 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  51.43 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  61.05 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  51.92 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  54.81 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  61.86 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  50.96 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  60.95 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  57.73 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  57.43 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  63.44 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  58.59 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  61.86 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  57.14 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  63.44 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  63.44 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  59.6 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  54.46 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  58.1 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  51.92 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  59.79 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  59.79 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  49.04 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  49.04 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  57.29 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  48.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  48.54 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>