More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3235 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3235  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.40462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.57 
 
 		 230 aa  333  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.48 
 
 		 230 aa  328  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.37 
 
 		 230 aa  327  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  70.67 
 
 		 233 aa  324  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.67 
 
 		 229 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  61.74 
 
 		 229 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  61.74 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.56 
 
 		 227 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  62.95 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.47 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6334  two-component regulatory system response regulator  62.67 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0204  two component transcriptional regulator  64.57 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00392261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0182  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.68 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.745426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0237  response regulator receiver  63.68 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2761  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 227 aa  247  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal  0.0571461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 231 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  50 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  48.23 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.11 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  48.92 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  48.65 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  47.06 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  45.95 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  48.87 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  45.74 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  44.14 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  46.88 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  46.19 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  46.43 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  46.43 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  46.43 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  46.43 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  46.43 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  46.43 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  46.43 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.25 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.25 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.25 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  43.81 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  44 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  43.81 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.81 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.81 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.81 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.2 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.92 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.92 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  41.52 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.48 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  43.23 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>