More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0056 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
357 aa  711  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.87 
 
 
367 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  54.21 
 
 
348 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.82 
 
 
354 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.16 
 
 
364 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.19 
 
 
363 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.3 
 
 
364 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.16 
 
 
364 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.72 
 
 
364 aa  327  2e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 
364 aa  326  4e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 
364 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.11 
 
 
358 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  49.32 
 
 
384 aa  322  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
364 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 
364 aa  320  2e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 
364 aa  320  2e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 
364 aa  319  4e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.32 
 
 
362 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  50.58 
 
 
374 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.27 
 
 
358 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 
358 aa  313  2e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.6 
 
 
349 aa  313  2e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.2 
 
 
355 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 
362 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.69 
 
 
356 aa  307  2e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  47.55 
 
 
456 aa  304  1e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.14 
 
 
348 aa  304  1e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 
352 aa  303  2e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 
358 aa  304  2e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.72 
 
 
363 aa  303  3e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.08 
 
 
354 aa  303  4e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.9 
 
 
357 aa  303  4e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.08 
 
 
354 aa  303  4e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 
359 aa  303  4e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
362 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.44 
 
 
343 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.66 
 
 
361 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.29 
 
 
356 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  49.85 
 
 
361 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 
355 aa  293  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  46.59 
 
 
348 aa  292  6e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.54 
 
 
357 aa  292  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
361 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.27 
 
 
362 aa  288  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 
352 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  45.58 
 
 
367 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.8 
 
 
352 aa  283  3e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 
348 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 
354 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.83 
 
 
340 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.96 
 
 
363 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.96 
 
 
363 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.45 
 
 
339 aa  275  9e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.72 
 
 
359 aa  275  1e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.01 
 
 
348 aa  275  1e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  45.7 
 
 
344 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 
361 aa  273  4e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.9 
 
 
346 aa  273  4e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 
344 aa  272  5e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 
340 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.12 
 
 
356 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  44.31 
 
 
344 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.67 
 
 
349 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.68 
 
 
363 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.36 
 
 
360 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.4 
 
 
357 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 
364 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
364 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  44.78 
 
 
340 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 
364 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 
349 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.67 
 
 
342 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.57 
 
 
348 aa  263  5e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 
358 aa  263  5e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.35 
 
 
344 aa  262  7e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  44.11 
 
 
360 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 
350 aa  261  1e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.33 
 
 
351 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  48.76 
 
 
370 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 
351 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 
351 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
335 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  43.64 
 
 
342 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 
344 aa  259  5e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 
365 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.21 
 
 
356 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 
360 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.21 
 
 
356 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  45.81 
 
 
336 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.21 
 
 
356 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 
344 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 
350 aa  258  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  47.01 
 
 
361 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 
353 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 
365 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.62 
 
 
353 aa  255  1e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 
339 aa  254  1e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.36 
 
 
344 aa  254  2e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
351 aa  254  2e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>