More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1352 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 305 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 305 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  53.49 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  55.59 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  53.04 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  52.36 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 322 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 297 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 297 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  44.67 
 
 		 297 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  47.24 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.55 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5168  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3330  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0162  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4125  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0971923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3391  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.279491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4776  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2806  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4128  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  33.45 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  33.45 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  33.45 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  33.45 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  33.1 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.82 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.07 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6140  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6428  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.410616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0713  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>