More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2338 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.15 
 
 
258 aa  362  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  70.82 
 
 
258 aa  356  2e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.18 
 
 
256 aa  350  9e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.18 
 
 
259 aa  341  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.44 
 
 
259 aa  339  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  66.67 
 
 
259 aa  337  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.93 
 
 
257 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.93 
 
 
257 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.47 
 
 
257 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  66.26 
 
 
240 aa  315  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  63.86 
 
 
245 aa  298  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.16 
 
 
259 aa  298  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.04 
 
 
266 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  55.72 
 
 
266 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.03 
 
 
257 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.72 
 
 
267 aa  272  4e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.02 
 
 
263 aa  271  8e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.26 
 
 
264 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.99 
 
 
273 aa  268  6e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.43e-05  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  55.08 
 
 
259 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  56.44 
 
 
284 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.11 
 
 
279 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  51.7 
 
 
265 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.58 
 
 
279 aa  258  5e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.47 
 
 
257 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  50.57 
 
 
263 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
269 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.3 
 
 
263 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.46784e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
259 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.75 
 
 
263 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.11011e-06  hitchhiker  9.70016e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.72 
 
 
268 aa  253  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.77 
 
 
260 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  2.29771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.93 
 
 
268 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  1.56624e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
263 aa  252  4e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.96 
 
 
263 aa  252  4e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
250 aa  252  5e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.93 
 
 
263 aa  251  8e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.34001e-07  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.35 
 
 
273 aa  251  9e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.35 
 
 
273 aa  251  9e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
259 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.69 
 
 
259 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 
259 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.07 
 
 
273 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.39023e-06  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.02 
 
 
268 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.02 
 
 
268 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  56.02 
 
 
268 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  51.09 
 
 
267 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.02 
 
 
268 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.02 
 
 
268 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.04 
 
 
257 aa  245  5e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.81 
 
 
267 aa  244  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.49519e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.31 
 
 
258 aa  244  1e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.47 
 
 
258 aa  243  2e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.78 
 
 
250 aa  243  2e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.23 
 
 
255 aa  242  4e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.81 
 
 
268 aa  242  4e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  5.89518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  56.02 
 
 
268 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.02 
 
 
268 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.95 
 
 
263 aa  241  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
259 aa  241  8e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  49.62 
 
 
252 aa  241  8e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.46 
 
 
252 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  49.63 
 
 
267 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  9.87439e-07  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.31 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.66 
 
 
259 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  48.46 
 
 
252 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
252 aa  238  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  46.04 
 
 
265 aa  238  6e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.97 
 
 
272 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.55 
 
 
255 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.43 
 
 
256 aa  234  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.72 
 
 
295 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.72 
 
 
295 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.53605e-09  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
251 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  45.38 
 
 
280 aa  232  4e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.38 
 
 
251 aa  231  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  45.38 
 
 
251 aa  231  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.87 
 
 
263 aa  231  7e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  55.08 
 
 
255 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.04 
 
 
258 aa  229  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.66 
 
 
258 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
251 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
257 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 
256 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
251 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
251 aa  222  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 
251 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
251 aa  221  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
251 aa  221  1e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.82 
 
 
260 aa  221  1e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
251 aa  221  1e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  47.31 
 
 
251 aa  219  2e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.31 
 
 
251 aa  219  2e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  47.31 
 
 
251 aa  219  2e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.31 
 
 
251 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.43 
 
 
254 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0843  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.61 
 
 
223 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.55491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.83 
 
 
250 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  48.83 
 
 
250 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>