55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2254 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 134 aa  276  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  57.81 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  59.35 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  57.72 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  59.66 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  58.4 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  52.34 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  53.91 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  53.91 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  53.12 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  52.85 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  58.82 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  54.55 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  53.12 
 
 		 128 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  52.1 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  41.41 
 
 		 286 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  41.41 
 
 		 286 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  41.41 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  28.32 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  29.55 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  26.77 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  27.56 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  25.2 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  29.55 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  29.1 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  28.03 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  26.09 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  32.8 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  28.24 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  30.34 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  29.21 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  30.68 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  26.52 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  31.87 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  32.88 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  25.2 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  31.87 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 182 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  22.34 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  22.34 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>