More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1361 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  85.68 
 
 		 467 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  66.81 
 
 		 472 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  73.5 
 
 		 471 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  76.65 
 
 		 469 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  79.62 
 
 		 476 aa  776    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  74.4 
 
 		 471 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  76.65 
 
 		 469 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  76.65 
 
 		 469 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  88.03 
 
 		 469 aa  842    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  72.83 
 
 		 462 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  68.18 
 
 		 472 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  77.34 
 
 		 470 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  76.43 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  75.28 
 
 		 469 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  76.65 
 
 		 490 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  75.72 
 
 		 469 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  76.65 
 
 		 469 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  75.28 
 
 		 469 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  82.95 
 
 		 493 aa  807    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  69.58 
 
 		 476 aa  655    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  74.61 
 
 		 468 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  76.21 
 
 		 469 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  74.4 
 
 		 471 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  84.06 
 
 		 483 aa  829    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  68.68 
 
 		 468 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  87.61 
 
 		 469 aa  840    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  72.9 
 
 		 468 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  74.89 
 
 		 468 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  75.88 
 
 		 469 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  76.65 
 
 		 469 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  75.28 
 
 		 469 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  75.55 
 
 		 489 aa  706    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  84.84 
 
 		 486 aa  830    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  75.06 
 
 		 490 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  84.84 
 
 		 486 aa  830    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  75.28 
 
 		 469 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 465 aa  953    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  81.29 
 
 		 488 aa  791    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  85.08 
 
 		 485 aa  833    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  70.52 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  68.83 
 
 		 485 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 		 464 aa  611  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  63.83 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 		 468 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 		 464 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  63.4 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 		 464 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 		 464 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  62.61 
 
 		 464 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  62.75 
 
 		 464 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  61.52 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  62.03 
 
 		 478 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  61.23 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  62.39 
 
 		 457 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  62.17 
 
 		 457 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  61.64 
 
 		 467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  61.42 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  63.47 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  58.84 
 
 		 469 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  61.69 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  62.61 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  59.78 
 
 		 466 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  61.28 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  62.44 
 
 		 465 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  59.06 
 
 		 467 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  57.7 
 
 		 458 aa  551  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  56.73 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  60.22 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  58 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  56.51 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 		 458 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  56.73 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  55.68 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56.79 
 
 		 458 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  57.08 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  57.08 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 458 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  49.79 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  52.34 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  51.3 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  51.72 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  50.86 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  50.8 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  46.97 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  53.74 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  49.57 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>