More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1204 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  100 
 
 		 638 aa  1333    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  43.05 
 
 		 424 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  42.72 
 
 		 422 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  42.72 
 
 		 422 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  42.05 
 
 		 373 aa  252  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  36.75 
 
 		 322 aa  241  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  38.59 
 
 		 356 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  38.59 
 
 		 357 aa  237  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  38.59 
 
 		 357 aa  236  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  38.59 
 
 		 357 aa  236  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  38.59 
 
 		 357 aa  236  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  38.26 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  38.26 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  38.26 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  38.26 
 
 		 357 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  38.26 
 
 		 357 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  38.41 
 
 		 357 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  38.41 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  38.08 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  38.94 
 
 		 338 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  38.08 
 
 		 364 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  38.08 
 
 		 364 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  41.09 
 
 		 345 aa  230  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  41.11 
 
 		 343 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  41.84 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  41.41 
 
 		 335 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  35.41 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  40.74 
 
 		 344 aa  219  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  39.93 
 
 		 333 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  41.41 
 
 		 335 aa  217  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  37.9 
 
 		 372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  38.14 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  37.82 
 
 		 372 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  37.54 
 
 		 383 aa  211  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  33.88 
 
 		 329 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  39.23 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  37.66 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  35.5 
 
 		 345 aa  207  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 		 329 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 327 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 327 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 327 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 327 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 327 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 329 aa  203  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 324 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  36.24 
 
 		 330 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  33.54 
 
 		 337 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  33.54 
 
 		 331 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 337 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 337 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  34.5 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  35.45 
 
 		 329 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  34.5 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  34.5 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  33.54 
 
 		 331 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  35.5 
 
 		 330 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  33.87 
 
 		 338 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  33.87 
 
 		 338 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  33.87 
 
 		 338 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  33.87 
 
 		 338 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  33.87 
 
 		 338 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  33.64 
 
 		 334 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  34.2 
 
 		 345 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.33 
 
 		 383 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 317 aa  188  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  32.9 
 
 		 331 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  34.08 
 
 		 322 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  31.84 
 
 		 381 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.66 
 
 		 345 aa  183  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  32.27 
 
 		 330 aa  180  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 302 aa  170  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 364 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  32.23 
 
 		 290 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  36.95 
 
 		 389 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  31.88 
 
 		 290 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  28.28 
 
 		 305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  28.89 
 
 		 318 aa  140  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  28.26 
 
 		 282 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  30.07 
 
 		 290 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  28.23 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 303 aa  122  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 324 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 337 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  29.2 
 
 		 331 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  29.2 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 314 aa  114  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  30.77 
 
 		 332 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  27.13 
 
 		 330 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  29.15 
 
 		 344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>