More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000391 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  100 
 
 
218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  54.33 
 
 
220 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  50.93 
 
 
221 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.47 
 
 
217 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.95 
 
 
223 aa  175  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.71 
 
 
218 aa  174  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.86 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.67 
 
 
218 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.03 
 
 
225 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.8 
 
 
217 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40 
 
 
221 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.95 
 
 
217 aa  167  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.8 
 
 
219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.88 
 
 
222 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.11 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.15 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.67 
 
 
223 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.8 
 
 
219 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.8 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.6 
 
 
222 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.6 
 
 
222 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.6 
 
 
222 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.6 
 
 
222 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.6 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.81 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.81 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.81 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.81 
 
 
222 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  38.81 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.81 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.81 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  38.81 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.81 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40 
 
 
221 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  36.74 
 
 
221 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.38 
 
 
223 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.21 
 
 
219 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.32 
 
 
224 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.78 
 
 
221 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.78 
 
 
221 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.22 
 
 
226 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.98 
 
 
221 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
222 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  35.11 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.06 
 
 
227 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.05 
 
 
238 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
223 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
233 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
223 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
204 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  34.44 
 
 
216 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  29.65 
 
 
241 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
217 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
249 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.89 
 
 
216 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.51 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  33.86 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  33.86 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
235 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.1 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.52 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.48 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.48 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.83 
 
 
456 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  33.69 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.39 
 
 
456 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.16 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  31 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.69 
 
 
218 aa  92  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.19 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.3 
 
 
231 aa  91.3  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
456 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.49 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  25.35 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.2 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  27.89 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  31.34 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  29.78 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  28.73 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.59 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  31.34 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.11 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.21 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  30.49 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>