More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2640 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  77.47 
 
 		 182 aa  295  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  75.82 
 
 		 182 aa  288  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  70.72 
 
 		 508 aa  272  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  67.03 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  64.29 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  68.13 
 
 		 182 aa  247  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  67.93 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  64.09 
 
 		 183 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  66.12 
 
 		 184 aa  244  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.89 
 
 		 506 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  63.19 
 
 		 183 aa  241  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  67.39 
 
 		 185 aa  237  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  68.13 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  68.83 
 
 		 184 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  65.75 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  48.31 
 
 		 451 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  50.87 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  43.72 
 
 		 210 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  44.39 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  44.07 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  43.79 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  43.79 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  39.31 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.17 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  40.98 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  39.89 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  42.94 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  43.4 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  41.98 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  41.76 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.58 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  41.14 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.2 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  44.38 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  43.71 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  46.48 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2589  sugar transferase  35.6 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  40.94 
 
 		 243 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  40.94 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.92 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  45.8 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.98 
 
 		 470 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5557  galactosyl transferase CpsE  41.62 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000713124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  44.3 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.86 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  45.03 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.17 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.17 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.17 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.56 
 
 		 456 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.36 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  40.54 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  42.07 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.63 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  46.21 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.18 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.14 
 
 		 454 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.74 
 
 		 501 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  47.92 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.3 
 
 		 491 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.03 
 
 		 448 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  46.4 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4237  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  31.98 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.952439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.33 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  39.05 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1932  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.17 
 
 		 518 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  47.14 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4532  sugar transferase  37.84 
 
 		 505 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0291  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.57 
 
 		 383 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.62 
 
 		 498 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.67 
 
 		 498 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.33 
 
 		 482 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  36.51 
 
 		 252 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2744  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.58 
 
 		 480 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000314973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  43.62 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3033  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  37.11 
 
 		 478 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  34.54 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3367  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.58 
 
 		 480 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  34.01 
 
 		 329 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0111  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.5 
 
 		 477 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.629672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.45 
 
 		 471 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  43.42 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  46.43 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  37.3 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.6 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  36.76 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.57 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.47 
 
 		 461 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17381  galactosyl-1-phosphate transferase  39.18 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2190  sugar transferase  36.84 
 
 		 475 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000191042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.51 
 
 		 520 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4820  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.51 
 
 		 242 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  42.38 
 
 		 494 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0295  sugar transferase  42.95 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0883  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.77 
 
 		 250 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.88 
 
 		 461 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1018  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.88 
 
 		 239 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.408286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1573  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  39.04 
 
 		 470 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2005  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  40.43 
 
 		 649 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.148419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>