More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1036 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
106 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0438  50S ribosomal protein L21  66.98 
 
 
106 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  56.19 
 
 
104 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 
104 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48.57 
 
 
104 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  46.67 
 
 
105 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
106 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.63 
 
 
104 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 
103 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  48.57 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0805  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.34 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 
149 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  45.71 
 
 
132 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.23 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  44.34 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.71 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  43.81 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  47.12 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.15 
 
 
103 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0644  ribosomal protein L21  38.46 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.315584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  87  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  40 
 
 
102 aa  87.4  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  39.81 
 
 
223 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  41.51 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  42.72 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  40.78 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  46.15 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  44.23 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>