More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0438 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0438  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
106 aa  210  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719851  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  66.98 
 
 
106 aa  153  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 
104 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48.57 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0805  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  41.9 
 
 
105 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.27 
 
 
104 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
106 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  47.12 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  42.31 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  42.86 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.4 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.23 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  40.78 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  41.9 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39.62 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0644  ribosomal protein L21  36.54 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.315584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37.86 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  38.24 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  37.25 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  40.78 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  36.54 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  37.14 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>