More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0031 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0031  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0483  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.17 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0814  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.51 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0791  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.13 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.3 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.464028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  28.28 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  26.53 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  25.7 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  26.82 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  25.25 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  25.26 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  24.48 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  26.44 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  26.1 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  30.52 
 
 		 569 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  25.35 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  26.78 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.47 
 
 		 612 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.22 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf510  thioredoxin reductase  26.03 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.9 
 
 		 551 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  24.17 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  27.27 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  25.67 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.62 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  25.17 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.03 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.79 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  25.16 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  24.83 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  27.4 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  26.69 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.6 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  24.26 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  26.78 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  25.17 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  26.78 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  26.78 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  30.6 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.42 
 
 		 555 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  26.42 
 
 		 453 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  26.78 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  26.23 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  32.07 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  23.61 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  24.74 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.59 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  26.1 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  29.67 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  26.23 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  27.03 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  26.92 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  27.17 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  25.17 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.49 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  25.56 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.81 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  26.09 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  25 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  24.5 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  25.9 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  24.59 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  24.59 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  24.59 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  24.59 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  25.25 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  28.73 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  26.69 
 
 		 304 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  23.84 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  22.3 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  26.78 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  23.84 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  23.26 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  29.21 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  23.86 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  23.84 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  23.93 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  24.64 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  23.86 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  23.92 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  29.21 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  22.62 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  25.91 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  23.51 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  25.25 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  24.16 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  25.68 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  28.65 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  24.14 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  24.14 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  29.19 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  23.93 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  23.59 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  23.18 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>