More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0483 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0483  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0031  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.17 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0791  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.93 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0814  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.93 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.27 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.464028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.92 
 
 		 555 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf510  thioredoxin reductase  27.3 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  24.24 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  26.35 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  28.75 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  27.24 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  23.47 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  26.9 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.44 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  24.38 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.18 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  24.44 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.4 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  30.7 
 
 		 569 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  24.59 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  22.61 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  22.61 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  25.82 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  25.99 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  32.46 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  22.74 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  22.88 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.42 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  23 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  23 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.21 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  24.44 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  23.83 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.74 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  22.04 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  23.68 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.45 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0449918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  23.89 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  24.76 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  26.14 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  23.45 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  25.42 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  23.45 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  22.93 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  23.1 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  24.13 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.04 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  27.14 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  23.42 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  25 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  23.3 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  23.9 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  23.73 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  23.08 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  23.36 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  25.68 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  23.4 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  24.01 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  23.23 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  23 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  26.3 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  25 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  24.05 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  23.45 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  24.3 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  23.73 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  23.83 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  26.42 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  23.73 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  22.78 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  23.73 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  22.48 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  23.73 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  23.73 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  25 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  23.3 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  23.03 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  23.25 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  23.93 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  24.59 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  23.62 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3844  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.06 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.672623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.03 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.71 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  22.54 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  23.61 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  23.43 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  27.27 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  22.22 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  22.4 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  23.1 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>