89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0164 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  100 
 
 
177 aa  358  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 
171 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  37.29 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60311e-08 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.89224e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  37.96 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3622e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.5989e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  40.3 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  40.3 
 
 
179 aa  83.6  1e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  81.6  5e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  37.96 
 
 
175 aa  79.3  3e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 
190 aa  79  3e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  33.11 
 
 
185 aa  75.5  4e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.6604e-05  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  35.04 
 
 
178 aa  73.9  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  34.31 
 
 
257 aa  72.4  3e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  34.31 
 
 
257 aa  72.4  3e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  41.04 
 
 
179 aa  72  4e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  36.73 
 
 
179 aa  71.6  5e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  36.73 
 
 
179 aa  71.6  5e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  39.57 
 
 
179 aa  70.9  8e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  38.85 
 
 
179 aa  70.1  1e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  38.07 
 
 
206 aa  70.5  1e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  36.05 
 
 
179 aa  69.3  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  67  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  65.9  3e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  31.25 
 
 
189 aa  65.9  3e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  38.73 
 
 
182 aa  65.5  4e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  37.14 
 
 
180 aa  64.7  7e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  37.14 
 
 
176 aa  64.3  8e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  37.14 
 
 
177 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  4.05508e-08 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  37.14 
 
 
176 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  35.25 
 
 
263 aa  62  4e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  35.92 
 
 
182 aa  61.6  6e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  62.5 
 
 
272 aa  58.9  4e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  37.14 
 
 
180 aa  58.9  4e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  35.38 
 
 
225 aa  57  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  59.18 
 
 
218 aa  57  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  59.18 
 
 
208 aa  57  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1086  17 kDa surface antigen  42.45 
 
 
238 aa  55.8  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
165 aa  54.3  8e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
165 aa  54.7  8e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  50.88 
 
 
216 aa  53.9  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  30.11 
 
 
179 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  58.14 
 
 
206 aa  52.4  3e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  30.94 
 
 
179 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  32.87 
 
 
376 aa  52.4  3e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  31.34 
 
 
171 aa  52.8  3e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  58.14 
 
 
204 aa  52.4  4e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1601  17 kDa surface antigen  41.01 
 
 
234 aa  52.4  4e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  53.19 
 
 
215 aa  52  4e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  53.19 
 
 
215 aa  52  4e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  53.19 
 
 
216 aa  51.6  5e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  30.7 
 
 
158 aa  48.5  5e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  53.49 
 
 
217 aa  47.8  9e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  34.78 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  35.82 
 
 
280 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  33.8 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  37.1 
 
 
213 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  25.6 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.41658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  32.67 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  1.08744e-05 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 
294 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  30.77 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.63697e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  28.95 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.36943e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  35.71 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  30.77 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.72178e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00354  hypothetical protein  40.82 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  32.32 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.3012e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  32.32 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0312  hypothetical protein  25.5 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  31.68 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.3242e-06  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.76746e-05  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  32.87 
 
 
178 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  34.56 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0282  hypothetical protein  25.5 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  48.65 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2730  hypothetical protein  38.78 
 
 
189 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>