More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1653 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  100 
 
 
277 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  62.55 
 
 
277 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  62.91 
 
 
277 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  60.92 
 
 
286 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  62.18 
 
 
277 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  62.68 
 
 
278 aa  344  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 
294 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 
290 aa  342  5e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  56.73 
 
 
281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  56.88 
 
 
279 aa  331  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  58.91 
 
 
276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  55.43 
 
 
279 aa  325  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  53.76 
 
 
280 aa  305  8.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  54.32 
 
 
280 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0253397  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  50.18 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  52.69 
 
 
281 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  48.38 
 
 
278 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  46.04 
 
 
278 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  56.89 
 
 
257 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  47.53 
 
 
272 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  47.51 
 
 
272 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  45.91 
 
 
278 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  46.98 
 
 
278 aa  248  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  45.2 
 
 
278 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  45.2 
 
 
278 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  45.2 
 
 
278 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  45.2 
 
 
278 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  46.01 
 
 
273 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  43.68 
 
 
276 aa  246  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 
272 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  45.71 
 
 
278 aa  244  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
272 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  45.42 
 
 
272 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  46.3 
 
 
273 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  44.49 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
272 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  43.82 
 
 
297 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  44.93 
 
 
272 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  44.92 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  45.59 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 
292 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 
334 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  45.19 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 
278 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  42.38 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
273 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
273 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
297 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  41.52 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  41.35 
 
 
275 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 
286 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 
278 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
273 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 
273 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  38.63 
 
 
273 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
273 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.35 
 
 
281 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
290 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  40.81 
 
 
273 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 
273 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.69 
 
 
273 aa  205  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  39.07 
 
 
275 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  41.6 
 
 
280 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
273 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
276 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  39.36 
 
 
274 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
273 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  39.31 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  38.27 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  45.53 
 
 
235 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  40.86 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 
317 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  38.77 
 
 
273 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
322 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
338 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
274 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  40.14 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  41.29 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  40.46 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  38.69 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  38.41 
 
 
273 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 
275 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  39.62 
 
 
324 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  41.48 
 
 
276 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  40.36 
 
 
274 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
324 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 
276 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
343 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  41.06 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>