81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2064 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.68254e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  66.36 
 
 
229 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  39.04 
 
 
239 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  34.32 
 
 
232 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  35.4 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  30.8 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  32.74 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  33.87 
 
 
266 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  28.82 
 
 
228 aa  84.7  1e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  30.8 
 
 
225 aa  81.3  1e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  32.6 
 
 
231 aa  79.7  4e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
228 aa  77.8  1e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  31.28 
 
 
227 aa  76.6  3e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  27.59 
 
 
240 aa  76.3  4e-13  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  29.09 
 
 
240 aa  76.3  4e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  33.92 
 
 
227 aa  75.5  6e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
223 aa  75.5  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  29.09 
 
 
240 aa  75.5  8e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  23.85 
 
 
235 aa  73.9  2e-12  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  31.62 
 
 
243 aa  73.6  2e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  34.07 
 
 
231 aa  72  7e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  31.92 
 
 
241 aa  71.2  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  31.3 
 
 
243 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  30.4 
 
 
240 aa  69.3  5e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  22.62 
 
 
229 aa  68.9  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  22.62 
 
 
229 aa  68.9  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 
214 aa  67.4  2e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
228 aa  66.6  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  25.33 
 
 
228 aa  66.6  3e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  24.44 
 
 
228 aa  66.6  4e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
228 aa  65.9  5e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
240 aa  65.1  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  37.39 
 
 
226 aa  64.7  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  31.49 
 
 
235 aa  61.6  9e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.32 
 
 
240 aa  61.6  9e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  31.88 
 
 
237 aa  61.6  9e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  30.8 
 
 
210 aa  60.8  2e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  32.86 
 
 
288 aa  60.5  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  30.87 
 
 
230 aa  60.1  3e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  34.93 
 
 
226 aa  60.1  3e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  21.27 
 
 
229 aa  59.7  4e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  34.93 
 
 
226 aa  59.7  4e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
240 aa  58.9  7e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  29.65 
 
 
228 aa  58.2  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  34.93 
 
 
309 aa  58.2  1e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  32.89 
 
 
232 aa  57  2e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  33.93 
 
 
224 aa  57  3e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  31.78 
 
 
247 aa  56.2  4e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  32.89 
 
 
228 aa  56.2  4e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  27.35 
 
 
225 aa  55.8  5e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
223 aa  56.2  5e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 
210 aa  55.1  9e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  31.9 
 
 
223 aa  55.1  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  34.58 
 
 
225 aa  54.7  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  29.01 
 
 
229 aa  55.1  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  32.47 
 
 
210 aa  54.7  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  34.62 
 
 
225 aa  54.7  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
231 aa  53.5  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  36.04 
 
 
244 aa  52.8  4e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 
210 aa  52.8  5e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.03 
 
 
232 aa  52.4  6e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  33.64 
 
 
238 aa  51.2  1e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  33.63 
 
 
218 aa  50.8  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  30.64 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  35.63 
 
 
218 aa  49.3  6e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  26.78 
 
 
224 aa  48.9  7e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  31.36 
 
 
223 aa  48.5  8e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  24.88 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  27.23 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  28.51 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  25.74 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.39 
 
 
230 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  29.25 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  28.21 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  36.52 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  22.75 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  27.85 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  28.44 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  27.73 
 
 
224 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  29.6 
 
 
230 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>