More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0192 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 312 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  61.04 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  58.94 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  58.61 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  58.61 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  57.7 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  57.38 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 315 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  54.93 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 313 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  56.72 
 
 		 315 aa  358  9e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  56.29 
 
 		 318 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  56.29 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  56.48 
 
 		 312 aa  355  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  56.17 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  53.62 
 
 		 315 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  55.41 
 
 		 315 aa  352  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  54.64 
 
 		 329 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  56.48 
 
 		 313 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  55.63 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  54.64 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  52.46 
 
 		 321 aa  348  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  56.45 
 
 		 311 aa  348  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  55.41 
 
 		 314 aa  346  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  56.95 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  54.29 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  54.3 
 
 		 319 aa  345  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  54.14 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  54.75 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  54.75 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  54.75 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  54.18 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  54.18 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  54.43 
 
 		 314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  51.23 
 
 		 332 aa  338  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  53.77 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  54.22 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  52.73 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  52.38 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  54.6 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  51.45 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  51.84 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  54.69 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  51.45 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  52.03 
 
 		 314 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  54.1 
 
 		 314 aa  318  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  51.16 
 
 		 322 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  52.81 
 
 		 307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  53.2 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  48.37 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  47.57 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  51.16 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  50.83 
 
 		 307 aa  298  8e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 312 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  46 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  47.25 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  53.72 
 
 		 301 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  51.88 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  51.88 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 307 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  47.59 
 
 		 363 aa  291  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  52.08 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  52.08 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  49.19 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>