More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2832 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
393 aa  766    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  73.99 
 
 
391 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  71.39 
 
 
397 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.41 
 
 
402 aa  338  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  46.74 
 
 
392 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  46.58 
 
 
396 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.91 
 
 
393 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  42.19 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.91 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  47.98 
 
 
393 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.27 
 
 
400 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  45.71 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  62 
 
 
251 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  44.5 
 
 
390 aa  256  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  41.1 
 
 
397 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  40.45 
 
 
396 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
389 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  41.88 
 
 
386 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  48.62 
 
 
261 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 
263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  50.39 
 
 
260 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  46.59 
 
 
259 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  44.66 
 
 
260 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 
261 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  44 
 
 
259 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  45.7 
 
 
265 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
272 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  44.23 
 
 
262 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  43.82 
 
 
256 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  43.82 
 
 
256 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  43.43 
 
 
256 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  47.9 
 
 
265 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  43.03 
 
 
256 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  40.93 
 
 
261 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  40.71 
 
 
255 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.52 
 
 
161 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  70.43 
 
 
128 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  39.13 
 
 
260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  45.1 
 
 
266 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  44.27 
 
 
256 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.43 
 
 
132 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  44.71 
 
 
266 aa  170  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  39.92 
 
 
260 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  42.04 
 
 
263 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  39.2 
 
 
271 aa  169  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  43.08 
 
 
265 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64.96 
 
 
154 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  42.04 
 
 
263 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  44.62 
 
 
272 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  40.41 
 
 
263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  40.82 
 
 
263 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.5 
 
 
134 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  40.08 
 
 
263 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.11 
 
 
128 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.52 
 
 
128 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  39.06 
 
 
262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
128 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
128 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
129 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
129 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
128 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
129 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  38.8 
 
 
258 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  38.49 
 
 
255 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  37.07 
 
 
263 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  39.83 
 
 
269 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  39.62 
 
 
270 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 
260 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
128 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
128 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 
287 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
128 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
128 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.29 
 
 
132 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
128 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.29 
 
 
132 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.79 
 
 
128 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 
128 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.54 
 
 
131 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  58.54 
 
 
130 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  38.85 
 
 
258 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  40.74 
 
 
263 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  38.49 
 
 
261 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  39.39 
 
 
265 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  38.68 
 
 
265 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  65.52 
 
 
131 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  39.45 
 
 
263 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  36.92 
 
 
270 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  38 
 
 
260 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56 
 
 
129 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  36.92 
 
 
270 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  41.15 
 
 
263 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  39.02 
 
 
261 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  38.28 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
360 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>