More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0938 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  100 
 
 		 315 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  90.79 
 
 		 315 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  88.25 
 
 		 315 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  82.54 
 
 		 315 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  82.86 
 
 		 315 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  81.9 
 
 		 315 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  81.9 
 
 		 315 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  78.12 
 
 		 320 aa  510  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  77.39 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  76.51 
 
 		 317 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  75.8 
 
 		 316 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  79.37 
 
 		 315 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  78.73 
 
 		 315 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  72.53 
 
 		 326 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  76.75 
 
 		 316 aa  467  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  75.46 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  74.45 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  74.14 
 
 		 323 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  74.14 
 
 		 323 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  72.98 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  71.79 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  73.27 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  71.02 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  71.16 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  52.55 
 
 		 323 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  49.34 
 
 		 300 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  49.34 
 
 		 300 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  49.34 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  49.01 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  49.01 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  48.36 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  48.03 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  47.7 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  47.49 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  47.85 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  47.47 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  47.51 
 
 		 299 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  46.38 
 
 		 303 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  47.32 
 
 		 308 aa  258  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  46.86 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  47.19 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  47.83 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  46.46 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  46.53 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  45.07 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  46.38 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  45.54 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  46.38 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  44.88 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  44.88 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  45.85 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  48.65 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  43 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  46.78 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  47.46 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.89 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  46.96 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  46.51 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  45.86 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.85 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  45.86 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  48.81 
 
 		 308 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  46.13 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.85 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  47.24 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  43.67 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.71 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  42.24 
 
 		 773 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  46.67 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  48.48 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  44 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  45.12 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  43.14 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  42.67 
 
 		 299 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  42.33 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  44.37 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  43.33 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  44.78 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  43.89 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  42 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  43.33 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  42 
 
 		 312 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  40.86 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  45.51 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  42 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  42.67 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  43.1 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>