90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0041 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0041  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 
457 aa  877  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.758493  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0125  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  66.29 
 
 
448 aa  582  1e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371605  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7829  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  46.53 
 
 
452 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0095  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  44.74 
 
 
448 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  34.22 
 
 
446 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0640  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  33.17 
 
 
438 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3437  nucleobase/cation symporter, (NCS1) family  35.66 
 
 
438 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1042  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  35.39 
 
 
438 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144538  normal  0.528331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2434  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.51 
 
 
434 aa  147  4e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.116228  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2203  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33 
 
 
429 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.703215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.85 
 
 
429 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2332  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.79 
 
 
438 aa  132  1e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  31.55 
 
 
427 aa  130  5e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  31.04 
 
 
427 aa  126  8e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  30.87 
 
 
427 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4975  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  28.64 
 
 
429 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4713  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  30.2 
 
 
427 aa  120  4e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.15 
 
 
457 aa  117  4e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.27 
 
 
446 aa  114  4e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2463  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.9 
 
 
435 aa  113  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0493  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.46 
 
 
430 aa  112  2e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113424  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  27.5 
 
 
446 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.1 
 
 
444 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.49 
 
 
450 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0569  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  24.21 
 
 
392 aa  84  5e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.69717e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1396  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  25.66 
 
 
385 aa  83.2  8e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.55309e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1599  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.69 
 
 
389 aa  83.2  8e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0130344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  27.66 
 
 
416 aa  80.9  5e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0257  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.46 
 
 
458 aa  75.5  2e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.19311e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.27 
 
 
479 aa  68.6  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4251  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.07 
 
 
476 aa  68.2  3e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4185  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.07 
 
 
476 aa  68.2  3e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4412  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.07 
 
 
476 aa  68.2  3e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.274319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0862  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.7 
 
 
507 aa  67  7e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.472129  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0055  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.15 
 
 
461 aa  66.6  8e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2142  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.33 
 
 
453 aa  60.1  7e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2557  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.27 
 
 
484 aa  60.1  9e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266727  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6281  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.31 
 
 
491 aa  59.7  9e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1140  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.37 
 
 
476 aa  57.8  4e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0460  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.84 
 
 
502 aa  57.4  5e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.51 
 
 
443 aa  56.6  9e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1249  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.56 
 
 
476 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1221  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.56 
 
 
476 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.45 
 
 
431 aa  56.2  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.19 
 
 
431 aa  55.1  2e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  26.15 
 
 
439 aa  55.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1129  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.37 
 
 
476 aa  53.5  7e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2380  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.57 
 
 
474 aa  53.5  8e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0564  hypothetical protein  25.07 
 
 
487 aa  53.5  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3297  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.48 
 
 
520 aa  53.1  1e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6019  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.03 
 
 
480 aa  52  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2066  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.18 
 
 
534 aa  52.4  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0417  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  23.33 
 
 
474 aa  51.6  3e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  24.81 
 
 
533 aa  51.6  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.02 
 
 
438 aa  51.2  3e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1795  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  23.33 
 
 
474 aa  51.6  3e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2519  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.33 
 
 
474 aa  51.6  3e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0465  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.33 
 
 
474 aa  51.6  3e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.446257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0831  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  23.33 
 
 
474 aa  51.2  4e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4383  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  23.87 
 
 
476 aa  50.8  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3697  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  35.44 
 
 
538 aa  50.8  4e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  27.4 
 
 
496 aa  50.8  5e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.84 
 
 
505 aa  50.8  5e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.54 
 
 
432 aa  50.4  7e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  27.4 
 
 
496 aa  50.4  7e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0768  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.48 
 
 
435 aa  50.1  8e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283527  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0291  permease, cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin family  23.82 
 
 
507 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  25.69 
 
 
524 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3034  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.22 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  21.98 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0628  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  23.83 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.01 
 
 
480 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  25.21 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18030  purine-cytosine permease-like transporter  34.78 
 
 
488 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.046034  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.44 
 
 
487 aa  47  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.55 
 
 
494 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0678  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.48 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232179  normal  0.0587875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.05 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2217  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin permease family protein  26.67 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.738305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  23.74 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4136  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.59 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121815  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30600  purine-cytosine permease-like transporter  24.71 
 
 
495 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.14 
 
 
500 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0333  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.62 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  23.99 
 
 
492 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2262  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.15 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2922  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.8 
 
 
489 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185419  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0405  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.96 
 
 
452 aa  43.5  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0202053  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3052  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.46 
 
 
459 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.34 
 
 
438 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>