More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2466 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  63.49 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  46.15 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  47.62 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  46.67 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  41.13 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  38.64 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  40.65 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  40.8 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  39.52 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  36.84 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  40.16 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  38.14 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  36.51 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  34.62 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  38.64 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  38.64 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  37.8 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  33.59 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  32.31 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  39.83 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  37.07 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  34.11 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1915  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.934218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  33.04 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  38.3 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  37.23 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  34.55 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  36.63 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  32.04 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.48 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  36.08 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  35.56 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  30.36 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  35.23 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  32.32 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  30.48 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.98 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  33.98 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  33.98 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  34.21 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  37.76 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  39.47 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0945  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  28.23 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  34.74 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  30.11 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  33.33 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  32.32 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  30.58 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  33.64 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  36.99 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.69 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  39.74 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  39.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  36.26 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  39.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1568  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.35 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  36.26 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  36.26 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>