More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0640 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  86.21 
 
 		 145 aa  259  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  73.1 
 
 		 145 aa  226  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  73.1 
 
 		 145 aa  226  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  51.37 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  50 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  39.57 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  39.57 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  41.48 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  39.42 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  41.48 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  40.58 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  44.62 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  37.69 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  35.11 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  38.4 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.04 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  41.28 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  40.37 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  43.12 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  47.22 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  37.69 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  37.61 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  40.37 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  44.76 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  34.56 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  37.72 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  39.45 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  33.82 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  33.82 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  41.27 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  37.88 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  39.62 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  39.81 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  41.03 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  38.64 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  43.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  39.45 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  39.25 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  36.43 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  39.09 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  38.53 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  42.11 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  38.53 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  38.53 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  38.53 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  34.4 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  38.53 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  40.37 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  36.97 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  39.45 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  41.35 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  38.32 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  41.51 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  38.74 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  37.84 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  41.35 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  41.9 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  44.34 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  42.73 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  39.25 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  39.45 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  40.37 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  40.37 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  39.32 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  32.84 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  32.84 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  36.45 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  41.35 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  36.92 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  41.44 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  32.8 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  34.86 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  40.95 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  38.78 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>