More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0797 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  47.73 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  47.73 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  44.58 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  43.02 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  41.18 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0712  acylphosphatase  36.78 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0537883 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  42.22 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  40.96 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  37.21 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  40 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  45.95 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  38.89 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  40.54 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  36.36 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  40 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  40 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.83 
 
 
766 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  45.71 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  36.47 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1494  acylphosphatase  39.77 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00408889  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1465  acylphosphatase  39.77 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.846334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  36.47 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.58 
 
 
757 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  40.51 
 
 
393 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  34.52 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  40.23 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  46.34 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  36.59 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0948  acylphosphatase  38.64 
 
 
201 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  40 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0622  acylphosphatase  36.56 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  39.44 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1607  acylphosphatase  35.16 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  38.55 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  35.53 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  41.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  41.03 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  34.88 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  41.18 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  45.59 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0752  acylphosphatase  36.36 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  39.53 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  36.96 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3852  acylphosphatase  42.17 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  35.29 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1727  acylphosphatase  41.25 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  43.21 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  34.09 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.36 
 
 
736 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  43.37 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  38.55 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.96 
 
 
767 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  41.67 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.96 
 
 
763 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  37.33 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  36.9 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  41.67 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  36.96 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  44.12 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  34.15 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  48.21 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.68 
 
 
753 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  40 
 
 
90 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  37.21 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  40.24 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.82 
 
 
778 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0949  acylphosphatases-like  37.65 
 
 
229 aa  54.3  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  41.67 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.51 
 
 
741 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  36.05 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  36.36 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  42.68 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  36.47 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0950  acylphosphatases-like  37.5 
 
 
215 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0951  acylphosphatases-like  38.89 
 
 
208 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  34.48 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  39.33 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  43.94 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  38.89 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.29 
 
 
779 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  43.08 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  35.63 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  36.78 
 
 
767 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  39.51 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.19 
 
 
920 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  41.03 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  42.86 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  37.04 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  37.93 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  40 
 
 
578 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>