299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_899 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  100 
 
 		 91 aa  192  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  79.12 
 
 		 91 aa  160  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  79.12 
 
 		 91 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  43.18 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  43.33 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  46.07 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  46.07 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  42.17 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  51.19 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  41.46 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  46.67 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  45.88 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  47.67 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  42.68 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  42.05 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  46.75 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  43.37 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  45.98 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  48.05 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  47.25 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  51.43 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  47.25 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  44.44 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  41.67 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  37.08 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  48.81 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  46.43 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  41.67 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  43.33 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  41.46 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  44.83 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  52.17 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  44.05 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  45.78 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  39.56 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  44.32 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.33 
 
 		 780 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  52.24 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  43.82 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  37.5 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  43.82 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  43.82 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  42.22 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  42.22 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  42.22 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  43.82 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  36.78 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  43.82 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  42.22 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  43.82 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.45 
 
 		 780 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  47.22 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  44.83 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  38.1 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  42.22 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  40.48 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  46.38 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  35.96 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  40 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  40.23 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  40 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  40.23 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  40 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  36.36 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  46.15 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40.45 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  46.58 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  43.18 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  43.48 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  44.78 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  36.9 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  35.63 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  36.78 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.33 
 
 		 776 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  38.89 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  50.72 
 
 		 767 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  44.16 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  43.75 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  43.75 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  41.46 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  36.36 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  37.65 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  43.75 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  44.59 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  44.78 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  40.48 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  34.07 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  38.82 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  37.78 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  46.07 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  36.9 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  44.05 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  34.12 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  42.86 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  34.07 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  42.86 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>