218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3598 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  70.79 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  60 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  60 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  54.55 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  63.38 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  58.33 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  56.47 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  52.27 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  52.27 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  52.27 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  53.49 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  52.94 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  56 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  45.88 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  47.73 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  49.41 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  51.76 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  52.27 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  50 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  46.43 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  47.13 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  44.19 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  40.74 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  43.33 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  42.53 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  42.22 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  40 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  41.56 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  34.88 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  44.3 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  43.04 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  41.86 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  43.68 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  36.59 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  38.82 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  45 
 
 		 567 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  40.24 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  40.24 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  54.05 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  36.05 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  40.51 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0681  acylphosphatase  48.33 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  42.35 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  42.5 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  36.05 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  39.08 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  42.35 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  39.13 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  47.76 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1857  acylphosphatase  37.21 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  36.05 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1303  acylphosphatase  43.21 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  42.42 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0948  acylphosphatase  35.63 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  44 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0206  acylphosphatase  34.88 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  41.86 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  45.16 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  48.53 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45.83 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  44.59 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  38.27 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0949  acylphosphatases-like  33.33 
 
 		 229 aa  51.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  38.55 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  38.27 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  35.71 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1727  acylphosphatase  48.28 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  41.27 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  41.27 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  45.21 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  43.64 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  46.03 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  35.06 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1541  acylphosphatase  35.29 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3162  hypothetical protein  31.4 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.618579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  34.72 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  33.33 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  39.24 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  40.74 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4027  acylphosphatase  53.52 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  42.86 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  42.86 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  41.67 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  41.67 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  41.67 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  41.79 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  35.23 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  43.24 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  39.02 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  43.24 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>