30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2347 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  734    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  57.09 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  56.48 
 
 		 314 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  55.48 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  54.97 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  45.79 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  44.67 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  26.74 
 
 		 181 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  28.26 
 
 		 178 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  28.21 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  31.68 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  29.38 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  29.38 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  31.3 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  28.19 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  26.32 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  31.78 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  25.61 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  27.85 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  25.81 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  28.23 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  29.7 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  25.36 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  26.25 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  29.69 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>