167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0484 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  919    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  41.04 
 
 		 528 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  41.18 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  37.78 
 
 		 527 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  37.78 
 
 		 527 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  38.72 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  37.38 
 
 		 511 aa  280  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  45.56 
 
 		 538 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  37.65 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  32.35 
 
 		 448 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  32.11 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  33.45 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  42.86 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  32.27 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  39.43 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  28.94 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  34.22 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  30.53 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  42.14 
 
 		 453 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07541  membrane-associated protease  35.94 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  33.56 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  42.39 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  42.42 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  33.98 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  40.51 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  30.08 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  39.19 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  44.58 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  28.42 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  28.65 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  26.32 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  36.63 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  40.48 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  26.32 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  28.42 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  27.37 
 
 		 337 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  27.37 
 
 		 346 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  35.56 
 
 		 225 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 337 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 337 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  27.37 
 
 		 337 aa  57  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  41.79 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  31.14 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  27.37 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2196  Abortive infection protein  34.51 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.260267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  35.87 
 
 		 225 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  40.45 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.73 
 
 		 234 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  30 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  27.08 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  27.08 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  27.08 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  25.43 
 
 		 238 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  27.08 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  26.04 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  34.3 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  27.08 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  26.04 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  26.04 
 
 		 249 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  38.68 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 203 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  25.77 
 
 		 249 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  37.8 
 
 		 257 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  29.14 
 
 		 274 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  28.75 
 
 		 250 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  37.35 
 
 		 240 aa  54.3  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  34.94 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  41.11 
 
 		 235 aa  53.9  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  40.7 
 
 		 321 aa  53.5  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  24.74 
 
 		 249 aa  53.5  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  34.62 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 237 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  32.29 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  35.42 
 
 		 241 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  23.89 
 
 		 228 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  32.63 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.87 
 
 		 225 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  30.86 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  23.89 
 
 		 228 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.89 
 
 		 228 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  34.74 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  23.89 
 
 		 228 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  34.13 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  34.13 
 
 		 140 aa  52  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  22.86 
 
 		 228 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  28.67 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  34.13 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  30.23 
 
 		 288 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  30.86 
 
 		 227 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  30.6 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 		 225 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 		 273 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  41.57 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.89 
 
 		 228 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>