38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2196 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2196  Abortive infection protein  100 
 
 
325 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.260267  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  36.08 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  35.19 
 
 
528 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  35.19 
 
 
515 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  34.51 
 
 
480 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  30.36 
 
 
527 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  30.36 
 
 
527 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  34.31 
 
 
527 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  31.4 
 
 
538 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  32.08 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  41.57 
 
 
241 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  33.98 
 
 
453 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  36.05 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  29.46 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  29.21 
 
 
458 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  41.56 
 
 
291 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  29.91 
 
 
448 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  29.91 
 
 
448 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  38.55 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  28.12 
 
 
271 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  30.69 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  36.89 
 
 
453 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  32.38 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  29.13 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  35.34 
 
 
192 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  29.1 
 
 
521 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  23.53 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  27.85 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  33.33 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  39.51 
 
 
193 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0859  Abortive infection protein  39.8 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  23.53 
 
 
237 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  23.53 
 
 
237 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  32.53 
 
 
198 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  23.53 
 
 
227 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  29.73 
 
 
420 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  33.7 
 
 
234 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  31.87 
 
 
237 aa  42.7  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>