102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1609 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  798    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  72.61 
 
 
384 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  67.84 
 
 
410 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  33.74 
 
 
441 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  35.33 
 
 
535 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  35.33 
 
 
535 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  34.1 
 
 
420 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  36 
 
 
437 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  33.17 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  31.36 
 
 
395 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  33.7 
 
 
430 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  35.92 
 
 
760 aa  232  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  36.44 
 
 
395 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  37.24 
 
 
380 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  31.91 
 
 
430 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  32.43 
 
 
406 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  33.33 
 
 
427 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  33.08 
 
 
427 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  30.83 
 
 
383 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  29.61 
 
 
345 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4471  protein of unknown function DUF187  32.1 
 
 
357 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4566  hypothetical protein  28.23 
 
 
335 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  23.59 
 
 
906 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  23.32 
 
 
906 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  25.51 
 
 
1099 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  24.76 
 
 
906 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  22.88 
 
 
911 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  26.05 
 
 
536 aa  76.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  25.54 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  26.62 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  22.77 
 
 
717 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  24.91 
 
 
570 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  24.4 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  24.4 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  24.4 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  25.96 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  25.96 
 
 
521 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  25.09 
 
 
515 aa  60.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  23.51 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  25.69 
 
 
676 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  24.46 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  24.09 
 
 
534 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  25.64 
 
 
521 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  24.56 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  25.64 
 
 
554 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  25.64 
 
 
521 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  25.64 
 
 
521 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  24.82 
 
 
439 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  22.66 
 
 
550 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  24.82 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  23.86 
 
 
669 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  24.82 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  24.82 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  24.56 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  24.47 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  24.47 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  23.45 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  21.91 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  24.65 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  23.28 
 
 
540 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  25 
 
 
551 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  22.42 
 
 
490 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  25.73 
 
 
520 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  24.83 
 
 
551 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  24.43 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  20.07 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  22.17 
 
 
519 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  24.43 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  22.17 
 
 
519 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  20.61 
 
 
481 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  22.71 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  22.49 
 
 
512 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  22.17 
 
 
519 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  22.46 
 
 
729 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  21.2 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  22.98 
 
 
532 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  21.46 
 
 
519 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  21.7 
 
 
519 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  22.22 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  21.3 
 
 
997 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  23.04 
 
 
538 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  22.96 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  23.71 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  20.55 
 
 
519 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  22.17 
 
 
519 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  20.98 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  18.35 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  21.76 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  22.97 
 
 
528 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  22.83 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  20.92 
 
 
806 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  20.83 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  20.5 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  20.75 
 
 
521 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2793  hypothetical protein  26.27 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  23.12 
 
 
547 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  20.61 
 
 
538 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  21.62 
 
 
508 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  23.08 
 
 
508 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  21 
 
 
523 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>