229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3734 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  70.81 
 
 
201 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  62.18 
 
 
201 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.9 
 
 
198 aa  201  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  52.31 
 
 
203 aa  187  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  48.11 
 
 
203 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  46.37 
 
 
189 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  44.86 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  42.65 
 
 
213 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  40.49 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  40 
 
 
202 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  41.71 
 
 
218 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  41.76 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  42.2 
 
 
216 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  35.33 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  35.62 
 
 
204 aa  109  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  32.39 
 
 
206 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  35.35 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.39 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  39.05 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  32.7 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  38.61 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.02 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  31.46 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  33.16 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  37.21 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  32.26 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  34.41 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.25 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  36.94 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  35.75 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  34.59 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  34.2 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  34.5 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  30.6 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  32.95 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  31.79 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  30.34 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  32.37 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  29.61 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  33.33 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  29.13 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  33.33 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  32.37 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  31.58 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  33.33 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  32.75 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  32.95 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  33.73 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  33.14 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  33.73 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  32.57 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  33.85 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  33.33 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  33.14 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  35.16 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  33.14 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  30.81 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  32.56 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  32.39 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  33.53 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  32.39 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  31.28 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  32.39 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  32.39 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  42.2 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  33.88 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  32.39 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  31.82 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  31.82 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  32.04 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  43.93 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  34.8 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  33.33 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  31.98 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  31.95 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.82 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  34.32 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  33.13 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  30.85 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  30.85 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  26.98 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.36 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.1 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  32.22 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.1 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.1 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  31.05 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  39.13 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  33.14 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  35.71 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>