161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2037 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  520  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  52.78 
 
 
257 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  34.46 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  33.15 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  36 
 
 
183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  37.09 
 
 
187 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  40.82 
 
 
201 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
180 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  33.71 
 
 
197 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  35.39 
 
 
185 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.58 
 
 
197 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  34.04 
 
 
190 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  36.91 
 
 
197 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 
186 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 
184 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  32.39 
 
 
189 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  38.78 
 
 
201 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  32.64 
 
 
191 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  34.48 
 
 
193 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
190 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.95 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  35.12 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  31.96 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
200 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  29.15 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
199 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
189 aa  89.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  35 
 
 
190 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 
191 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  38.26 
 
 
200 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  34.53 
 
 
203 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  38.52 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  33.67 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  28.86 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  31.17 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  35.12 
 
 
207 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  29.7 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.61 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  32.12 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  32.47 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  31.15 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.02 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  30.48 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  28.71 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  32.05 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  29.09 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.18 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
182 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  32.37 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  29.47 
 
 
195 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  34.36 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  32.57 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  32.85 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.87 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  31.55 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  32.84 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  33.85 
 
 
145 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  31.85 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0991  hypothetical protein  36.47 
 
 
195 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351934  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  28.99 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  32.59 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  26.54 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  32.24 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  32.67 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5899  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  26.06 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  25.86 
 
 
195 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  30.16 
 
 
182 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  32.24 
 
 
198 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 
195 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
214 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  34.25 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  26.56 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  24.67 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  33.99 
 
 
197 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  26.6 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.87 
 
 
204 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  32.65 
 
 
186 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  33.6 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  29.37 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  22.45 
 
 
190 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  27.66 
 
 
191 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  22.47 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  30.41 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  27.12 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>