102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5110 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
145 aa  298  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  32.03 
 
 
188 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  38.71 
 
 
180 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  37.1 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  37.1 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  34.33 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  36.64 
 
 
182 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  33.85 
 
 
253 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  31.97 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  35.11 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  33.87 
 
 
200 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  30.99 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  31.34 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  31.75 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  30.3 
 
 
245 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.93 
 
 
241 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.1 
 
 
190 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  31.65 
 
 
251 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  30.07 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.01 
 
 
201 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  31.75 
 
 
203 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  28.81 
 
 
203 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  28.91 
 
 
242 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  31.5 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  32.33 
 
 
257 aa  57.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 
189 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  30.16 
 
 
203 aa  57  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  29.08 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  30.33 
 
 
187 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  27.97 
 
 
192 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  40.32 
 
 
227 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  27.21 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  32.33 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  27.61 
 
 
193 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
195 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  28.12 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  28.15 
 
 
244 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  26.87 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  27.97 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  29.29 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  25.78 
 
 
200 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  28.68 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  31.62 
 
 
218 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 
207 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  27.21 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  27.74 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  34.38 
 
 
189 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
193 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  33.96 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.11 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  24.82 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  30.08 
 
 
215 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  34.57 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  28.17 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  28.7 
 
 
207 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  29.17 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  32.88 
 
 
182 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  29.27 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  27.69 
 
 
204 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  27.56 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  25.18 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  25.19 
 
 
207 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  22.22 
 
 
184 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  31.19 
 
 
204 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  24.09 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  29.66 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  25.2 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  34.67 
 
 
242 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  25.56 
 
 
189 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  39.62 
 
 
214 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 
186 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 
188 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
223 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  31.86 
 
 
194 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  30.34 
 
 
195 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  29.31 
 
 
205 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4107  protein of unknown function DUF820  30.99 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  26.73 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  23.02 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 
195 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>