66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0991 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0991  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351934  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5899  hypothetical protein  69.59 
 
 
197 aa  256  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  48.37 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  50.27 
 
 
189 aa  160  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  36.47 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.1 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.7 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  26.82 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  23.63 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  30.1 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  29.01 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.8 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4303  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  35 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  29.3 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  30.95 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4506  protein of unknown function DUF820  29.49 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  27.84 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0761  hypothetical protein  28.77 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.591699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  28.74 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0921  hypothetical protein  29.3 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1051  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
189 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0285636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  24.71 
 
 
187 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  27.71 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  42.31 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  28.75 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.4 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5029  hypothetical protein  34.74 
 
 
143 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4400  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.1 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3150  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 
188 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000141566  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.71 
 
 
189 aa  44.7  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  22.68 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  31.4 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  32.5 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  35.29 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  23.08 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.43 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  40.91 
 
 
227 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  22.99 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  44.68 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  30.72 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4452  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  0.551953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
251 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4389  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.94 
 
 
195 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3655  protein of unknown function DUF820  24.68 
 
 
187 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  35.46 
 
 
191 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  28.17 
 
 
187 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3923  protein of unknown function DUF820  26.62 
 
 
191 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  24.6 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.69 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>