50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5042 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.71 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  33.11 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.29 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  31.06 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  33.81 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  32.72 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  31.43 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  31.98 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.12 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.74 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  31.76 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  33.56 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.65 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.79 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.65 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.65 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  28.82 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.81 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  34.09 
 
 		 358 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.71 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  26.67 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  31.67 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  31.61 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  26.87 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  28.89 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  28.15 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  26.44 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  29.1 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.46 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  31.36 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  31.36 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  31.36 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  32.28 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.97 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  26.86 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  27.49 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.75 
 
 		 274 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  27.94 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  29.86 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  27.94 
 
 		 141 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  27.94 
 
 		 141 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.23 
 
 		 135 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>