More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2388 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  100 
 
 		 360 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  76.8 
 
 		 348 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  76.58 
 
 		 335 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  58.31 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  59.42 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  55.72 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  56.13 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  55.59 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  54.73 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  53.41 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  53.41 
 
 		 350 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  56.07 
 
 		 327 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  54.19 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  55.56 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  55.14 
 
 		 327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  53.27 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  55.24 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  52.98 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  52.16 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  53.8 
 
 		 352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  54.98 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  52.11 
 
 		 344 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  51.75 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  51.75 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  52.98 
 
 		 351 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  54.21 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  54.69 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  52.35 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  50.89 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  53.23 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  54.66 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  55.24 
 
 		 338 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  52.22 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  54.18 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  52.83 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  53.35 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  54.72 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  51.57 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  52.48 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  52.48 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  51.76 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  49.84 
 
 		 323 aa  298  9e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  52.82 
 
 		 315 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  52.85 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  51.25 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  51.48 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  50.8 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.67 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  50.33 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  49.68 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  49.83 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  50.5 
 
 		 316 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  51.48 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  50 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  50 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  50 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.83 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  46.62 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  51.79 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  51 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  51.32 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1120  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  49.51 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  48.29 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0575  PhoH family protein  48.95 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0928819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  50.33 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  50 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  48.69 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  52.44 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  52.44 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  52.44 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2524  PhoH family protein  50 
 
 		 328 aa  282  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.150245  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  52.44 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  49.68 
 
 		 342 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  49.34 
 
 		 319 aa  281  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  50.99 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  50 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  51.5 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  50.47 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  50.99 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  50.32 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  49.69 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  47.58 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  50.67 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  47.24 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  51.79 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  49.67 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  51.15 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  48.32 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  50.33 
 
 		 319 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  50.33 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  50.99 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  50.16 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  52.13 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  47.8 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>