85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  75.09 
 
 		 298 aa  427  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  64.89 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  65.48 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  64.87 
 
 		 292 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  64.21 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  66.06 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  63.93 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  63.93 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  63.57 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  64.06 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  61.57 
 
 		 292 aa  352  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  61.48 
 
 		 283 aa  346  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  58.27 
 
 		 284 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  61.34 
 
 		 280 aa  324  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  58.24 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  57.35 
 
 		 289 aa  318  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  55.36 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  61.34 
 
 		 280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  56.93 
 
 		 279 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  55.88 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  57.35 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  55.02 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  54.04 
 
 		 285 aa  288  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  54.51 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  50.54 
 
 		 301 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  53.19 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  50.91 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  55.04 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  51.82 
 
 		 283 aa  275  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  51.67 
 
 		 306 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  46.24 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  47.48 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  50.53 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  45.49 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  47.92 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  46.15 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  44.44 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  39.76 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  32.38 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  36.47 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  31.94 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  29.33 
 
 		 330 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.86 
 
 		 329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  30.07 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  30.07 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  30.07 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  28.18 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  27.91 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  29.45 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  28.87 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  29.02 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  30.41 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  29.76 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  29.05 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  29.47 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  26.41 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  28.52 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  28.38 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  27.49 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.24 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  27.42 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  29.51 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  27.76 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  26.52 
 
 		 353 aa  92.8  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  25.94 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  26.86 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  26.83 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  28.57 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  27.56 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  26.85 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.2 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  27.33 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  25.17 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  24.01 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  26.41 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  25.1 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  25.19 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  24.81 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  27.21 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  22.44 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.75 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  21.26 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.08 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>