109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  100 
 
 		 114 aa  236  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  60.17 
 
 		 118 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  62.07 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  58.56 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  57.02 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  56.14 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  62.5 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  57.94 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  59 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  52.48 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  52.48 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  58.76 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  64.89 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  55.77 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  55.45 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  52.38 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  48.15 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  50.91 
 
 		 122 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  55.79 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  48.65 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  53.15 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  55.43 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  53.54 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  45.61 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  57.78 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  49 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  59.18 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  42.27 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  45.54 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  28.42 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  29.35 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  25.44 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  34.07 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  30.69 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  31.91 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  30 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  26.04 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  28.89 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  27.08 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  27.45 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  26.04 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  29.55 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  33.72 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  33.73 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  28.09 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  27.66 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  27.27 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  26.04 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  26.17 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  30.68 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5645  hypothetical protein  28.42 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0407513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  31.52 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  28.89 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  30.19 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  29.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  30.95 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  24.47 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  26.6 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  26.32 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  26.6 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  26.6 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  24.55 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  29.76 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  26.32 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  22.92 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  22.92 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  28.24 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2796  hypothetical protein  24.75 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00736684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3230  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0638  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  26.39 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  26.39 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0206  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1387  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0454  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0474  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2813  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  24.75 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  23.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  26.09 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  30 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  27.38 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0314  protein of unknown function DUF485  30.56 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  27.38 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>