58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5173 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 139 aa  274  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  44.86 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  55.43 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  55.43 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  45.37 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  56.04 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  52.17 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  45.45 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  46.46 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  45.79 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  49.49 
 
 		 118 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  47.52 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  53.85 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  45.37 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  46.46 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  45.54 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  46.15 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  50 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  42.59 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  54.65 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  44.74 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  47.42 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  45.76 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  47.42 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  50.54 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  46.74 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  44.44 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  39.39 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  52 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  43.48 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  33.01 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  36.14 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  29.29 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  29.13 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  29.13 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  29.59 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  29.17 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  29.59 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  28.12 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  27.55 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  29.59 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  25.77 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  36.67 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  28.05 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  32.41 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>