53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1423 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  96.26 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  56.57 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  56.57 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  54.55 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  54.55 
 
 		 102 aa  116  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  52.53 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  50.51 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  50.51 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  48.48 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  48.48 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  51.49 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  45.54 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  42.57 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  40.59 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  32.29 
 
 		 115 aa  57  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  34.34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  35.29 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  31.46 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  30.93 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  27.62 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  27.27 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  29.29 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  26.73 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  22.55 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  21.57 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  29.91 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  27.59 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4011  hypothetical protein  33 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  27.47 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  31.31 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  32.53 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  29.17 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  29.31 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  32.98 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  30.19 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  27.17 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  29.52 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3673  hypothetical protein  20.59 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1671  hypothetical protein  20.59 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  30.69 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>