51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3168 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  63.06 
 
 
110 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  65.66 
 
 
109 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  62.5 
 
 
119 aa  120  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  59.57 
 
 
122 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  55.56 
 
 
120 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  50.88 
 
 
121 aa  116  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  58.51 
 
 
122 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  56.84 
 
 
126 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  54.74 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  53.54 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  54.74 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  55.43 
 
 
118 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  52.58 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  55.88 
 
 
116 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  56.12 
 
 
122 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  50 
 
 
110 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  48.45 
 
 
133 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  54 
 
 
112 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  50.98 
 
 
138 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  60 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  47.57 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  53.61 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  47.47 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  53.49 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  45.36 
 
 
124 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  51.46 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  45.79 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  40.45 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  31.91 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  26.47 
 
 
113 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  29.03 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  32.22 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  27.59 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  31.11 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  25.26 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2737  hypothetical protein  35.44 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394683  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  29.31 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  27.17 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  29.31 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  25.26 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  25.26 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  24.21 
 
 
103 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  32.14 
 
 
99 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  26.67 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  25.53 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  25.53 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  25.53 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>