62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3287 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  59.41 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  56.44 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  56.44 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  57.43 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  56.44 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  51.02 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  49.5 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  48.98 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  51.49 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  51.49 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  33 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  34 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  34.02 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  35 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  31 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  34.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  31.91 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  30 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  27.08 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  33.72 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  31.37 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  29.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  33.73 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  29.79 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  30.53 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  39.06 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  25.25 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  28 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  32.65 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  43.1 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  31.31 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  30.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  26.32 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  29.59 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  28.42 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  30.21 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  32.05 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  25 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  29.03 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  29.03 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 		 115 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  27.37 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  25.53 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  29.49 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  29.49 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  29.47 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  32.81 
 
 		 122 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>