93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1761 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  200  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  37.35 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  37.21 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  40.96 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  31.96 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  35.71 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  31.4 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0969  hypothetical protein  37.8 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1671  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3673  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12005  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  36.78 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  36.78 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  36.9 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  36.78 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  36.78 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  30.69 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  35.71 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  35.71 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  34.12 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  36.05 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3676  hypothetical protein  38.82 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.637378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  35 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  31.4 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  33.73 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  32.93 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  33.71 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  35 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  29.89 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  35.63 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 
122 aa  48.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  39.68 
 
 
133 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  34.52 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  33.71 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  30.68 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  30.68 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  30.68 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  29.41 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  31.11 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  31.76 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  32.58 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  31.46 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  43.1 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  36.36 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  30.59 
 
 
103 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  31.33 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1541  protein of unknown function DUF485  30.43 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000112878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  33.8 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  31.03 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  31.46 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  31.03 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  32.53 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  30.1 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2796  hypothetical protein  36.9 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00736684  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  30.23 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  24.72 
 
 
104 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 
114 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  29.55 
 
 
102 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  34.43 
 
 
110 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  35.71 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  31.25 
 
 
103 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  29.41 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  29.89 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  31.25 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  30.14 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  30.77 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5956  hypothetical protein  31.76 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  30.21 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>