120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1160 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 115 aa  237  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  54.46 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  52.68 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  58.33 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  58.76 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  56.86 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  56.57 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  53.7 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  50.88 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  52.21 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  58.82 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  56.25 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  56 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  51.38 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  53.61 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  53.61 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  51.75 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  55.79 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  53.19 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  54.46 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  54.74 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  56.52 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  47.32 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  56.04 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  48.96 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  52.69 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  50 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  43.88 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  57.29 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  44.86 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  31.68 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  31.68 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  32.98 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  34.74 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  32.29 
 
 		 107 aa  57  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  32.29 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  28.71 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  25.49 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  29.03 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  31 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  29.03 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  29.03 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  31.52 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  28.26 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  25.77 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  28 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  26.32 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  27.78 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  28.41 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  24.73 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  28.44 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  23.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  26.8 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  21.88 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  27.17 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  22.64 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  30.77 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3702  hypothetical protein  27.19 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  21.7 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  27.47 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  25.77 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  21.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  21.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  21.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  21.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  21.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  27.37 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  22.83 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  25.77 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  25.53 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  27.47 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  27.47 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  23.96 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3759  protein of unknown function DUF485  23.21 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3842  protein of unknown function DUF485  23.21 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  26.97 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  26.97 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5645  hypothetical protein  26.04 
 
 		 120 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0407513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  26.19 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  25.77 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  31.25 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  26.32 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  26.37 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  31.11 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  24.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  24.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  24.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  24.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>