50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1372 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  95.1 
 
 		 102 aa  197  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  63.73 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  63.73 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  59.8 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  59.8 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  62.63 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  59.8 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  59.8 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  58.82 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  59.8 
 
 		 102 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  58.82 
 
 		 102 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  51.02 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  42.57 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  42.57 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  29.59 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  27.96 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  28.89 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  27.47 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  32.22 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  27.27 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  26.6 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  30.3 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  28.72 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  31.87 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  25 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  28.26 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  29.41 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  29.13 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  25 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  30.93 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  32.65 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  27.17 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  25.61 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  28.24 
 
 		 105 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  28.24 
 
 		 105 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  30.86 
 
 		 121 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  34.69 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  33.67 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  30.12 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>