108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4054 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  97.14 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  74.26 
 
 
138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  68.32 
 
 
116 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  64.65 
 
 
119 aa  137  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  59.6 
 
 
133 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  55.45 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  54.08 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  53.06 
 
 
126 aa  123  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  52.48 
 
 
114 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  57.89 
 
 
116 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  51.96 
 
 
110 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  63 
 
 
118 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  54.9 
 
 
111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  53.61 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  54.55 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  59.18 
 
 
136 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  58.24 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  52.34 
 
 
122 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  51.46 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  53.12 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  52.63 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  48.51 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  51.4 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  53.06 
 
 
110 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  45.36 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  46.24 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  45.45 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  55.43 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  37.78 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  34.02 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  35.63 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  35.63 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  35.63 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  35.63 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  37.08 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  31.68 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  36.26 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  31.96 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  31.96 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  31.96 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  34.83 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  30.53 
 
 
103 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  30.53 
 
 
103 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  30.53 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  31.31 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  31.31 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  32.61 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  32.61 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5645  hypothetical protein  31.52 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0407513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  29.55 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  28.74 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  28.87 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  29.67 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  29.07 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  28.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  31.52 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  34.44 
 
 
142 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  31.31 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  26.97 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  31.87 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  34.15 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  32.29 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  29.59 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  25.24 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  29.41 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  34.15 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  31.76 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  34.15 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  28.87 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  28.87 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  28.87 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  28.87 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  28.87 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  28.87 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  27.84 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  36.25 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  27.72 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5956  hypothetical protein  32.05 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  26.73 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  28.24 
 
 
102 aa  42  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  29.07 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  26.88 
 
 
104 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4961  hypothetical protein  31.76 
 
 
120 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249965  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  29.07 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>