146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1074 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  68.93 
 
 
111 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  70.87 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  71 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  57.94 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  60 
 
 
119 aa  120  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  61.22 
 
 
138 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  56.73 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  54.37 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  51.75 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  55.88 
 
 
116 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  59.79 
 
 
116 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  51.46 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  51.46 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  49.11 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  48.21 
 
 
126 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  54.29 
 
 
115 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  49.04 
 
 
124 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  52.08 
 
 
133 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  48.48 
 
 
109 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  48.54 
 
 
121 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  54 
 
 
114 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  46.79 
 
 
110 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  49.06 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  48.48 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  53.68 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  45.71 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  41.44 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  39.22 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  47.42 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  35.71 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  35.11 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  33.68 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  27.45 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  33 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  29.67 
 
 
102 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  31.58 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  32.22 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  33 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  34.78 
 
 
117 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  32.22 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  32.22 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  32.22 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  31.11 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  31.96 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  28.28 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  30.11 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  30.43 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  29 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  30.43 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  30.43 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  27.72 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  29.9 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  31.11 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  31 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  30.53 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  31.33 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  31 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  31.52 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  31.33 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  28.92 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  31.87 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  32.38 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  31.31 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  31.31 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  31.31 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  31.82 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  28.92 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  30.56 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  31.87 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  28.57 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  28.41 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  32.65 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>