47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0348 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  55.56 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  56.57 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  55.79 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  57.78 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  56.98 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  47.79 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  47.93 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  56.32 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  53.33 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  52.69 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  52.08 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  53.33 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  41.44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  45.13 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  49.04 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  51.06 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  42.86 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  45.16 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  50.54 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  48.98 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  47.83 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  47.31 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  46.24 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  46.24 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  48.45 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  41.44 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  48.94 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  51.55 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  35.79 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  41.05 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  24.56 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  24.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  24.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  24.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  24.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  24.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  23.33 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  30 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  23.68 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  29.76 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  28.57 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  30.19 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  30.19 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  26.04 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>